Ciencia de los materiales complementarios

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• Texto complementario
• Figuras S1 a S37
• Subtítulos para las tablas S1 a S6
• Subtítulos para películas S1 – S31
• Referencias

Lista de verificación de reproducibilidad de MDAR

Cuadro S1

Estadísticas de recopilación, refinamiento y validación de datos de Cryo-EM.

Cuadro S2

Datos de espectrometría de masas de reticulación CPIC^SCP.

Cuadro S3

Datos de espectrometría de masas de reticulación CPIC^PUMA.

Cuadro S4

Datos de espectrometría de masas de reticulación MPIC^SCP.

Cuadro S5

Reticulación de datos de espectrometría de masas hPIC^SCP.

Cuadro S6

Conjunto de datos de espectrometría de masas de reticulación p53-hPIC^HDM2.

Fotos, videos y otros medios

Película S1

Mapa Cryo-EM y modelo TFIID sin promotor en conformación canónica (TFIID^canónico) con una resolución de 9,0 Å.

Película S2

Mapa Cryo-EM y modelo TFIID sin promotor en conformación reordenada (TFIID^reorganizado) con una resolución de 9,8 Å.

Película S3

Mapa Cryo-EM y conformación de descarga de TBP original del modelo TFIID unido al promotor (TFIID^ITL) Con SCP con una resolución de 6,8 Å.

Película S4

Mapa de Cryo-EM y modelo de TFIID unido al promotor en la conformación de carga posterior a TBP (TFIID^ROTURA) Con SCP con una resolución de 8,6 Å.

Película S5

Mapa Cryo-EM y modelo de módulo IID-A aislado con resolución de 3,2 Å.

Película S6

Mapa Cryo-EM y modelo de módulo IID-B aislado con resolución de 2,8 Å.

Película S7

El mapa Cryo-EM y el modelo del módulo IID-C se han purificado localmente a una resolución de 3,0 Å.

Película S8

Configuración separada de módulos IID-A e IID-B.

Película S9

Mapa Cryo-EM y modelo TFIID enlazado PUMA promotor en la conformación de carga TBP original (CP^PUMA-TFIID^ITL) Al 7,9 Å más cercano.

Película S10

Mapas Cryo-EM y modelo de modelo p53-cPIC^HDM2. Modelo estructural general de P53-cPIC^HDM2 se mostró en un mapa de combinación crio-EM. Se combinaron mapas purificados localmente de Pol II y TFIID. Los contactos intermodulares se muestran en el mapa.

Película S11

Mapas Cryo-EM y modelo cPIC^PUMA. Modelo de estructura general CPIC^PUMA se mostró en un mapa de combinación crio-EM. Se combinaron mapas purificados localmente de Pol II y TFIID.

Película S12

Mapa Cryo-EM y modelo de módulo TBP de mPIC^PUMA purificado localmente a una resolución de 3,8 Å.

Película S13

Mapa Cryo-EM y modelo de módulo TBP de hPIC^SCP purificado localmente a una resolución de 3,4 Å.

Película T14

Un modelo de separación modular emparejada en el promotor durante la transición de TFIID^ROTURA para cPIC en promotores TATA-DBE (por ejemplo, SCP), lo que sugiere un ensamblaje de cPIC en el carril I.

Película S15

Un modelo para colocar la separación modular en el promotor durante la transición de TFIID^ROTURA cPIC solo en promotores TATA (ejemplo JUNIO), que se refiere a la configuración cPIC en la línea IIa.

Película S16

Un modelo para colocar la separación modular en el promotor durante la transición de TFIID^ROTURA cPIC en promotores sin TATA (ejemplo PUMA), que se refiere a la configuración cPIC en la vía IIb.

Película S17

Mapas Cryo-EM y modelo mPIC^PUMA complejo. Modelo MPIC^PUMA se mostró en un mapa de combinación crio-EM. Se combinaron mapas de refinamientos dirigidos del promotor Pol II-TFIIF-TFIIE, TFIID y TBP-TFIIA-TFIIB.

Película T18

Modelo de configuración CPIC PIC^PUMA para mPIC^PUMA aparece en dos vistas diferentes. Pueden ocurrir movimientos similares con otros promotores TATA-less y TATA solamente.

Película T19

Mapas Cryo-EM y modelo mPIC^SCP. Modelo MPIC^SCP se mostró en un mapa de combinación crio-EM. Se combinaron mapas de las mejoras avanzadas del módulo principal de PIC, TFIID y TFIIE. Los contactos intermodulares de TFIIE-Pol II, TFIIE-TFIID y promotor TFIID-Pol II se mostraron en el mapa general a un nivel de umbral más bajo.

Película S20

Modelo de cambios conformacionales inducidos por TFIIE durante el ensamblaje de PIC a partir de cPIC^SCP para mPIC^SCP aparece en dos vistas diferentes. Pueden ocurrir movimientos similares con otros promotores TATA-DBE.

Película S21

Mapa Cryo-EM y modelo hPIC. Modelo estructural general de P53-hPIC^HDM2 aparece en el mapa combinado crio-EM. Se combinaron mapas purificados localmente de Pol II-TFIIF, promotor TBP-TFIIB-TFIIA, núcleo TFIIH, TFIIE, TFIIH-CAK y TFIID. Los contactos intermodulares del CAK-Pol II se muestran en el mapa CAK.

Película S22

Mapas Cryo-EM y modelo hPIC^PUMA complejo, como en la película S21.

Película S23

Modelo de cambios conformacionales inducidos por TFIIH durante el ensamblaje de PIC a partir de mPIC^SCP a pre-hPIC^SCPy hPIC^SCP. Pueden ocurrir movimientos similares con otros promotores TATA-DBE.

Película S24

Modelo completo de ensamblaje PIC en promotor TATA-DBE (carril I) sobre Pol II. Los modelos estructurales se derivan de estructuras CPSCP-TFIID^ROTURA, mPIC^SCP y hPIC^SCP.

Película S25

Un modelo completo del ensamblaje PIC en el promotor TATA-DBE (Capítulo I). La película se preparó como en la película S24 e imita el ensamblaje PIC con cromatina con Pol II y GTF moviéndose alrededor del promotor.

Película S26

Modelo de proceso de configuración de PIC de mPIC^PUMA al hPIC^PUMA aparece en dos vistas diferentes.

Película S27

Modelo completo de ensamblaje PIC solo en el promotor TATA (carril IIa) encima de Pol II.

Película S28

Modelo completo de ensamblaje PIC en promotor TATA únicamente (Capítulo IIa). Esta película imita el ensamblaje PIC de cromatina con el que Pol II y GTF se mueven alrededor del promotor.

Película S29

Modelo completo de ensamblaje PIC sin promotor TATA (carril IIb) encima de Pol II. Película S30:

Película S30

Un modelo completo de un ensamblaje PIC sin un promotor TATA (Capítulo IIb). Esta película imita el ensamblaje PIC de cromatina con el que Pol II y GTF se mueven alrededor del promotor.

Película S31

Modelo completo para ensamblaje PIC basado en TFIID con diferentes tipos de promotores nucleares.